Comenzó sus estudios de artes marciales con la disciplina de Kendo a la edad de 7 años. Posteriormente se introdujo en el Karate y Judo.
Impartió clases de Judo a los soldados americanos en una base militar, lo que le hizo ver que los soldados, además de ser fuertes y corpulentos, aprendían las técnicas, para las que ellos necesitaban años de una forma muy rápida. Esta situación provocó en él la necesidad de buscar las auténticas tradiciones guerreras.
Durante esta época estudió Shinden Ryu Jujutsu con Yashiro Sensei, Shindo Tenshin Ryu y Asayama Ichiden Ryu con el Maestro Ueno Takashi.
Posteriormente conoció al Gran Maestro Toshitsugu Takamatsu mediante una recomendación de uno de sus maestros anteriores. En 1957, cuando tenía 26 años, fue aceptado por Takamatsu Sensei como estudiante personal.
Hatsumi Sensei viajó duarnte 15 años regularmente a la ciudad Kashiwabara para recibir las enseñanzas de su maestro.
El 2 de Abril de 1972 a la edad de 85 año, fallece el Gran Maestro Toshitsugu Takamatsu. Años antes, Takamatsu Sensei decidió pasar a Hatsumi Sensei el título de Soke de las siguientes escuelas:
34º Soke Togakure Ryu Ninpo
28º Soke Gyokko Ryu Kosshijutsu
28º Soke Kukishinden Ryu Happo Hikenjutsu
26º Soke Shinden Fudo Ryu Dakentaijutsu
21º Soke Gyokushin Ryu Ninpo
18º Soke Koto Ryu Koppojutsu
15º Soke Gikan Ryu Koppojutsu
17º Soke Takagi Yoshin Ryu Jutaijutsu
14º Soke Kumogakure Ryu Ninpo